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细胞通过各种各样的方式调节蛋白质的功能，包括通过修改蛋白质的结构。蛋白质可在一瞬间呈现另一种形式，不执行功能，甚至执行“错误”的功能：在人类中，折叠错误的蛋白质会导致严重的疾病，如阿尔茨海默氏症、帕金森氏综合症和囊胞性纤维症。这些蛋白质有一些也易于“感染”其他同类型的分子，并聚集成不溶性的所谓淀粉样纤维或斑块。这些淀粉样蛋白会伤害细胞和组织，使人得病。

打破束缚的方法

直到现在，一直都缺乏相应的方法，来定量记录复杂生物样品中的结构改性蛋白质。虽然有一系列的技术可研究结构改变的蛋白质，如X射线晶体学、核磁共振光谱学和其他光谱技术，但是它们都不能用来分析复杂的生物样品。研究人员用于研究细胞中蛋白质结构变化的其他程序也有其局限性：在分析之前，必须特别地标记感兴趣的蛋白质，以使科学家们能够在样品中观察它们。然而，这种方法仅对一个样本中的一些蛋白质是可能的。

几种方法的组合

为了开发新的方法，研究人员将一种“老”技术与蛋白质组研究的一种现代方法相结合。首先，将常用的消化酶（如蛋白酶K）添加到样品中，这种酶可根据蛋白质结构，将蛋白质切断为更小的碎片，称为肽类。根据所发现的肽类，可以确定和量化最初存在于样品中的蛋白质。

是什么让它如此特别：消化酶可切断在不同地方具有不同结构的同种蛋白质，从而产生不同的片段。就像指纹一样，这些片段可被很清楚地分配到蛋白质的单个结构中。

引起帕金森症的蛋白质

基于这种新方法，研究人员设计了一个实验来专门测量复杂的、未纯化样品（如血液或脑脊液）中“健康”和“生病”版本的α突触核蛋白。α突触核蛋白，当其结构发生改变的时候，被认为可导致帕金森症。病理结构变化与其同类聚集形成淀粉样纤维，可损害神经细胞。

借助于实验，科学家们能够直接测量复杂样品中的致病性和非致病性α突触核蛋白的确切数量。该试验还产生了蛋白质结构的信息。

越来越多的淀粉样变性

随着时间的推移，α突触核蛋白的浓度无法作为生物标志物，因为帕金森症患者和正常人血液或脑脊液中的蛋白质水平太过相似。Picotti教授称：“然而，致病性和非致病性α突触核蛋白结构的比值，很有可能会随着时间变化及疾病的进展而发生变化。因为这种新方法可使我们能够测量各种各样样品中α突触核蛋白的两种结构，那么将来我们可以用它来开发这种疾病的新生物标志物。”使用这种方法也有可能发现其他的、至今仍未知的淀粉样蛋白，根据先前知识它们与疾病有关。